Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLDN25C9JDP6 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLDN25C9JDP6 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLDN25C9JDP6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLDN25C9JDP6 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLDN25C9JDP6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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