Protein–RNA interactions for Protein: C9J2C7

NT5C1B-RDH14, NT5C1B-RDH14 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NT5C1B-RDH14C9J2C7 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms