Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVV-2B6SEH9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms