Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ODF3BA8MYP8 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.4 ms