Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH22Q9UJ99 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms