Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APEX2Q9UBZ4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APEX2Q9UBZ4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms