Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RRBP1Q9P2E9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms