Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALCOCO1Q9P1Z2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms