Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FANCFQ9NPI8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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