Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms