Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TUBB2BQ9BVA1 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBB2BQ9BVA1 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms