Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf16Q9BUW7 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms