Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SGIP1Q9BQI5 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms