Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SGCZQ96LD1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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