Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC97Q96F63 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms