Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM71DQ8N9W8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms