Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPAS3Q8IXF0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms