Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF2Q5BJF6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms