Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB6CQ53S08 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms