Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 KXD1-217ENST00000602094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CRP-201ENST00000255030 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 APLF-201ENST00000303795 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GAS7-204ENST00000437099 8003 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 BRINP2-201ENST00000361539 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC005865.1-201ENST00000432994 3004 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 EPHB1-211ENST00000493838 2786 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSCAN30-202ENST00000420878 4323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 EVL-203ENST00000544450 3704 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PSAPL1-201ENST00000319098 4680 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00303-201ENST00000367207 1891 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LGALS9-203ENST00000395473 3114 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PLK4-209ENST00000513090 3123 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TPTE-205ENST00000622113 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 BAHD1-202ENST00000560846 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CHRNB1-202ENST00000536404 1623 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SATB2-AS1-205ENST00000450728 3314 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SEMA4G-205ENST00000517724 2675 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A25-AS1-201ENST00000418747 6391 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 C3AR1-201ENST00000307637 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP25-1Q3LHN0 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms