Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ATP6V1FQ16864 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms