Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC18A3Q16572 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC18A3Q16572 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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