Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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