Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDCD2Q16342 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PDCD2Q16342 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PDCD2Q16342 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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