Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VPS72Q15906 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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