Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD1Q15327 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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