Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
HERC3Q15034 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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HERC3Q15034 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERC3Q15034 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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