Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NCAPHQ15003 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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