Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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COL19A1Q14993 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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COL19A1Q14993 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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COL19A1Q14993 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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COL19A1Q14993 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
COL19A1Q14993 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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