Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
GBX1Q14549 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms