Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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