Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ALKBH1Q13686 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms