Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SEMA5AQ13591 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms