Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SMAD4Q13485 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SMAD4Q13485 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SMAD4Q13485 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SMAD4Q13485 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMAD4Q13485 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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