Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB3BPQ13352 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms