Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms