Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2C1P98194 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms