Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD3P84022 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms