Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms