Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ARMC9-215ENST00000614261 4975 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CD34-201ENST00000310833 8246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P61574 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 316.3 ms