Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCA4P51532 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms