Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCNN1GP51170 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms