Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA8P48165 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA8P48165 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA8P48165 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA8P48165 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA8P48165 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA8P48165 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA8P48165 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA8P48165 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA8P48165 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA8P48165 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA8P48165 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GJA8P48165 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GJA8P48165 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GJA8P48165 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms