Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PSMB10P40306 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PSMB10P40306 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 296.5 ms