Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNGA1P29973 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms