Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLD1P28340 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLD1P28340 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms