Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PRKCHP24723 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms