Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGS1P23219 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGS1P23219 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGS1P23219 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGS1P23219 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGS1P23219 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGS1P23219 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGS1P23219 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTGS1P23219 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTGS1P23219 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTGS1P23219 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS1P23219 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms