Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRHP20396 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRHP20396 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 GOLGA2-210ENST00000490628 428 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC138781.1-201ENST00000501322 505 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC147067.2-201ENST00000608161 289 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRHP20396 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRHP20396 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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