Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCP1P17987 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms